侦查系始建于1985年，是吉林警察吉林警察学院成立最早的系部，下设7个教研室，分别为侦查学基础理论教研室、刑事案件侦查教研室、信息化侦查教研室、预审学教研室、政治安全保卫教研室、公安情报与反恐怖教研室、禁毒教研室。专兼职教师35人，其中高级职称比例58.6%，博士比例51.7%。客座教授20人，兼职教官35人。

侦查系现有侦查学、公安情报学和禁毒学三个本科专业。其中，侦查学专业为国家一流本科专业建设点，公安部全国首批重点专业建设点，吉林省特色高水平专业。目前建成2门国家级一流本科课程，2门省级一流本科课程，1门省级思政示范课程，1门省级“虚拟仿真”一流课程，拥有2个吉林省高等学校优秀教学团队。

教师队伍整体结构合理，素质较高，呈现出良好的发展趋势。现拥有全国优秀教师1人，公安部教学名师1人，吉林省优秀教师1人，国家级专业带头人1人，省级优势特色学科带头人1人，吉林省“拔尖创新人才”第二层次2人，吉林省有突出贡献人才2人，吉林省高层次C类人才2人，吉林省高层次D类人才2人，吉林省高层次E类人才4人。

多年来，侦查系重视科研、教学及实战业务合作平台的建设，现建设有1个省级社科平台，2个省级校企合作平台，1个校级智库，1个校级协同创新平台；2个校级重点实验室；建有1个省级本科高校卓越人才培养校外实践教学基地，1个省级实验教学示范中心；建有2个业务警种合作平台。